（一）擬訂全市創新驅動發展戰略以及科技發展規劃、計劃和政策，并組織實施和監督檢查。
（二）統籌推進全市科技創新體系建設和科技體制改革，指導科研機構改革發展和新型研發機構建設，推動企業科技創新能力建設，承擔推進科技與金融結合、科技軍民融合發展相關工作。會同有關部門健全科技創新激勵機制，推進重大科技決策咨詢制度建設。
（三）牽頭建立市級科技管理平臺和科研項目資金協調、評估、監管機制，組織管理市級科技計劃并監督實施。會同有關部門提出優化配置科技資源的政策措施建議，推動多元化科技投入體系建設。
（四）編制市級科技計劃并組織實施，統籌基礎研究、關鍵核心技術、現代工程技術、產業變革技術等研發和創新，牽頭組織重大技術攻關和重大科技成果轉化產業化和應用示范。
（五）擬訂科技創新與成果轉化、基礎設施與條件保障等基地平臺布局規劃并組織實施，參與組織重大科技基礎設施建設。負責科技社會組織相關管理工作。推動科研條件保障建設和科技資源統籌開放共享。
（六）組織擬訂高新技術發展及產業化、科技促進農業農村和社會發展的規劃、政策和措施。組織開展重點領域技術發展需求分析，提出重大任務并監督實施。
（七）負責全市技術轉移體系建設，擬訂科技成果轉移轉化及產業化和促進產學研結合、科技知識產權創造的相關政策措施。指導科技服務業、技術市場和科技中介組織發展。
（八）統籌區域科技創新體系建設，指導區域創新發展、科技資源合理布局和協同創新能力建設。
（九）負責高新技術產業開發區指導服務協調工作。指導各類科技園區和創新創業載體建設。組織培育高新技術企業。
（十）負責科技監督評價體系建設和相關科技評估管理，指導科技評價機制改革，統籌科研誠信建設。組織實施全市創新調查和科技報告制度。指導科技安全和科技保密工作。
（十一）會同有關部門擬訂科技人才隊伍建設規劃和政策，參與全市科技人才隊伍建設。
（十二）擬訂國際科技合作與交流的政策和措施，組織實施政府間的國際科技合作計劃，協調推進跨國（境）技術轉移工作，指導國際科技合作基地和外資研發機構建設。
（十三）負責引進國外智力工作。擬訂引進外國專家規劃、計劃并組織實施。建立重點外國專家、團隊吸引集聚聯系服務機制。擬訂出國（境）培訓規劃、政策和年度計劃并監督實施。
（十四）負責省級及以上科學技術獎和南通市科技興市功臣的組織與申報工作。
（十五）完成市委、市政府交辦的其他任務。