市政府國有資產監督管理辦公室設下列內設機構：
（一）綜合科（政策法規科）。負責機關日常運轉，承擔機關宣傳、文電、會議、信息、機要、安全、保密、檔案、政務公開等工作；擬訂機關各項規章制度并督促落實；負責機關年度工作目標的編制、分解、檢查和考核工作；負責機關財務、資產管理和后勤服務等工作；組織開展國有企業改革發展、國有資產監管重要問題的調查研究工作；提出完善國有資產監管的政策建議；承擔綜合性文稿起草工作；組織起草國有資產監督管理的規范性文件，擬訂有關規章、制度；承擔機關政策性文稿審核協調和規范性文件的合法性審查；承擔機關行政復議、行政應訴等工作；研究國有企業改革發展中的有關法律問題，指導推動所監管企業法治建設和法律顧問工作；承辦機關法律事務；按照管理權限，承擔所監管企業領導人員考察工作并提出任免建議；負責對所監管企業領導人員的日常管理工作；負責所監管企業董事會及董事隊伍建設，做好外部董事日常管理工作；擬訂向市屬國有控股和參股公司派出國有股權代表的方案；指導所監管企業人才工作、教育培訓工作；承擔機關的干部人事、機構編制、勞動工資、教育培訓和對外合作交流等工作；負責機關的黨群工作；協助有關部門指導所監管企業黨的建設；指導和推進所監管企業意識形態工作、思想政治工作、企業文化建設工作、精神文明建設工作和履行社會責任；指導所監管企業的統戰和黨外知識分子工作；協調所監管企業的工會、青年、婦女工作；加強完善民主管理機制，負責信訪工作，指導和協調所監管企業維護穩定方面工作；負責離退休干部工作。
（二）財務監管與考核分配科（督查科）。承辦所監管企業財務預決算工作；指導所監管企業建立健全會計和財務管理制度；綜合研究國有經濟和所監管企業的運行狀況；承擔所監管企業清產核資和資產損失核銷工作；指導所監管企業風險管控；組織做好所監管企業內部審計工作；承擔企業國有資產統計分析工作；分類完善所監管企業負責人經營業績考核制度；對所監管企業負責人進行年度和任期經營業績考核，并做好考核結果的應用；規范所監管企業工資分配管理，調控所監管企業工資分配水平，提出企業負責人薪酬制度和激勵辦法并組織實施；規范所監管企業負責人履職待遇、業務支出和職工福利保障；提出國有企業收入分配制度改革的指導意見；負責有關監督成果在機關科室和所監管企業的利用工作；擬訂監督工作有關制度；對有關方面移交的需要企業自行整改落實的問題，向企業印發監督檢查情況通報或整改通知，并督促企業整改；對有關方面移交的可能造成國有資產流失的問題線索，按規定開展延伸檢查，對涉嫌重大違紀違法的，按規定程序移交有關部門；對有關方面提出的有關國有資產監管的工作建議，按照職能分送相關科室研究落實并跟蹤督促；對有關方面監督檢查發現的共性問題，組織開展專項核查；對所監管企業組織開展國有資產重大損失調查，研究提出所監管企業重大資產損失責任追究的意見建議；指導所監管企業安全生產、節能減排、環境保護等工作。
（三）產權資本監管科（企業改革發展科）。研究提出完善國有產權管理的意見，擬訂企業國有產權管理的規章制度和管理辦法；承擔所監管企業產權登記、轉讓、劃轉、處置等工作；承擔所監管企業資產評估項目的核準和備案工作；審核所監管企業的資本金變動、股權管理及發債方案；監督、規范企業國有產權交易；研究建立國有資本運作制度，組織指導國有資本投資、運營公司開展國有資本運營，推動國有資本保值增值；指導所監管企業對所從事的金融業務加強管理；歸口管理國資辦履行多元投資主體企業股東職責有關工作；組織所監管企業上交國有資本收益；承擔擬訂國有資本經營預算有關制度的工作；承辦國有資本預決算編制、執行的有關工作；研究提出國有經濟布局和結構戰略性調整的政策建議；指導所監管企業布局和結構調整；審核所監管企業的發展戰略和規劃，對所監管企業重大投資進行監管；負責所監管企業國際化經營戰略的牽頭組織及境外投資管理工作；研究提出國有企業改革的政策建議；指導國有企業的現代企業制度建設；擬訂所監管企業合并、股份制改造、上市、合資等重組方案；提出所監管企業國有資本投資公司、運營公司的改組和組建方案；承辦所出資的國有獨資公司章程的審核工作。
另按有關規定設立機關黨組織。