一、內設機構
1.辦公室
負責掌握研究全市公安工作情況、開展調查研究；起草、審核涉及全局性工作的重要文件、會議報告和匯報材料；督促局重大事項的落實及主要領導批示的落實；負責建議提案辦理工作；負責局務會議和局重要會議的會務工作及局領導政務活動的協調安排；受理群眾政府信息公開申請、答復以及主動公開工作；市長信箱辦理、答復工作；負責公安統計歸口管理工作；負責局機關文件、信件收發工作；負責全局各類檔案的集中、統一管理工作。
2.政治處
負責干部人事、機構編制、勞動工資等工作；組織實施全市公安機關招錄人民警察工作。規劃、指導全市公安民警教育、訓練工作。負責指導全市公安機關思想理論教育工作；組織全局理論學習。
3.警備保障室
負責全市公安機關基本建設、后勤保障；擬訂全市公安機關經費管理辦法等制度和公安裝備、被裝配備標準；組織購置、調撥等勤務保障工作；組織實施裝備、物資、器材的配備、管理、倉儲和調運工作。
4.指揮中心
掌握全市社會治安動態情況，牽頭負責局總值班工作；規范指導全市公安機關110報警服務工作，負責全市110群眾報警受理、社會聯動處置；負責指導、檢查、協調全市公安機關綜合指揮室建設。
5.法制大隊
負責全市公安機關法制建設的規劃與組織協調，指導公安機關的法制工作；指導、檢查公安執法工作，負責內部執法監督、審核；承辦公安行政復議、應訴和國家賠償等工作。
6.警務督察大隊
組織全市公安機關警務督察工作；圍繞公安中心工作和重大警務部署開展現場督察；受理、核查、督辦對公安機關及人民警察的檢舉、控告；開展全市公安機關維護民警正當執法權益工作；負責和指導全市公安機關的審計工作。
7.治安警察大隊
負責對公共場所、特種行業、槍支彈藥、民用爆炸物品以及危險物品的治安管理；負責治安案件查處和指導工作；負責常住人口、暫住人口、居民身份證管理和指導工作；負責指導全市公安派出所和社區警務工作；指導、監督全市保安服務業的管理工作。
8.交通警察大隊
組織、指導、監督全市公安機關依法查處道路交通違法犯罪行為，處理道路交通事故，維護道路交通安全、道路交通秩序、公路治安秩序；指導相關單位落實交通安全責任；組織指導全市公安機關道路交通應急管理和重大活動道路交通安全保衛工作；負責駕駛證申領、考試、審驗；負責非機動車注冊登記和管理；指導、檢查、監督重點運輸單位的交通安全管理。
9.刑事警察大隊
組織、指導、監督全市公安機關開展對刑事犯罪的偵查工作；組織指導刑偵基礎建設，承辦禁毒有關協調等工作。
10.經濟犯罪偵查大隊
組織、指導、監督全市公安機關對經濟犯罪案件的偵查工作。
11.出入境管理大隊
負責全市公民因私出國（境）管理，會同有關部門開展非法入境、非法居留、非法就業外國人治理和非法移民遣返工作，組織、協調全市公安機關跨國（境）案件偵辦協作工作。
12.巡特警大隊
負責全市巡防工作的組織指導、規劃設計等工作；負責特定區域部位的武裝巡邏、先期接警，為危難群眾提供緊急救助；參與重大群體性事件處置、重大自然災害救援；參與組織重大活動安全保衛和等級警衛任務；負責黨政重要會議及活動的安全保衛工作。
13.監所管理大隊
負責羈押被依法逮捕、刑事拘留的犯罪嫌疑人；監管法律規定留所執行的罪犯。負責對被依法決定行政拘留、司法拘留的男性人員執行拘留。
14.水上警察大隊。
指導全市內河水域治安管理工作，研究水上治安動態并制定相應對策；指導、協調長江如皋段治安管理工作；負責全市長江水上管轄區域的治安管理工作；負責長江岸線如皋段水運系統單位及碼頭的治安管理；協調水上大型活動的安全保衛工作。
15.信訪室
指導全市公安信訪工作；負責公安信訪事項的復查、復核工作；負責協調信訪工作對外交流；協調辦理跨區域的信訪事項。
二、派出機構
根據區域劃分和工作需要，下設20個派出所，主要負責各管轄區域公安工作。